试用期发3000不合法，低于正式工资6000的80%。根据《劳动合同法》，试用期工资不得低于正式工资的80%，即不得低于4800元。若低于此标准，公司可能面临法律处罚，且员工有权要求补发差额。
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处理方式有协商、投诉、仲裁三种。建议先与公司协商，协商无果可向劳动监察部门投诉，仍无法解决则可申请劳动仲裁。选择时需考虑效率与成本。
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不合法，应处理。具体操作：1. 与公司人事沟通，要求按法律规定调整试用期工资；2. 若公司拒绝，向当地劳动监察大队投诉，并提供工资证明；3. 如投诉无果，申请劳动仲裁，需准备劳动合同、工资单等证据，按程序进行。