法律分析：用人单位扣除劳动者工资应遵循的规定有，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。
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若劳动者劳动合同中的违约情况，有可能会被扣工资，扣工资是否合法需要结合实际情况而定。
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实际中，被单位扣工资，如果是劳动者因自身问题耽误工作，适当扣除部分工资是合法的，当然，不同公司会有不同的规定。