擅自改变房屋结构可能影响合同效力。依据《合同法》，合同需合法且不违背强制性规定。若改变结构违法，合同可能无效，且面临处罚。
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处理此问题常见方式为协商或诉讼。应先与房东协商，寻求解决方案；若协商无果，可提起诉讼，由法院判定合同效力及责任。
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合同效力需具体分析。若改变结构未影响安全，可协商继续履行；若影响安全或违法，应停止使用并协商解除或变更合同；协商不成则诉讼解决。